清朝末，直隶瘟疫流行。御医秦药石借瘟疫之际，勾结药商，制造冤狱，图谋私利。新任御史卫丁，为彻查冤狱，投身太医院，做了一名御医。卫丁和秦药石自此成为了一生的对手。围绕着一块神医之匾，和一本医书，卫丁和他的对手亲身见证了清末三十光怪陆离的世道；亲历了帝王家的勾心斗角，悲欢离合。待阅尽沧桑，尘埃落定，秦药石死在了帝国的夕阳里，同为尘土；而卫丁最终以医入道，终成一代大家。