太古时期，巫、妖共世。女娲为寻找哥哥伏羲展开了一场洪荒世界的冒险之旅，但却意外误杀了太阳神帝俊之子，从而引起了一场旷世之战。帝俊带领妖族大军压境，伏羲、女娲为保护族苍生四处联络巫族部落组成联盟。为了寻找能与之匹敌的大神东皇太一，女娲与祝融、共工一同再次踏上了冒险之路。一路的艰险使得女娲与祝融相爱，而共工也正因此叛变加入了妖族。最终东皇太一答应相助，巫、妖大军齐聚不周山。帝俊法力高深，巫族伤亡惨重，太一牺牲自己将帝俊困在东皇钟内同归于尽。妖族势弱，共工不堪失败，与祝融背水一战。共工惨败，一怒之下撞倒了不周山，随即天塌地陷，天上出现裂痕，天火顺势而降。女娲不忍生灵涂炭，淬炼五色神石，飞往天际时裂缝扩张严重。危机之刻她毫不畏惧，用身体弥补了裂缝。女娲补天终结了巫妖大战，迎来了新的和平时代。