国际大都会日本东京，光天化日之下发生了性质极其恶劣的抢劫案。某个十字路口发生诡异的交通事故，科学搜查班（ST）的各位顺藤摸瓜查清了事故的始作俑者——天才黑客镝木彻（中山裕介饰）。但是ST的领导者赤城左门（藤原龙也饰）面对众人对镝木的指控闪烁其词，他支开百合根友久（冈田将生饰），独自前往镝木的住所。未久，镝木葬身火海，而赤城作为重要嫌疑人被同僚拘捕。青山翔（志田未来饰）、结城翠（芦名星饰）、黑崎勇治（漥田正孝饰）、山吹才藏（三宅弘城饰）等手下自然不会相信赤城的认罪供词，他们想方设法要查清真相，而百合根更为此故意犯罪进入拘留所，试图近距离听取赤城的心声。而就在关键时刻，赤城越狱逃亡……